元至正二十一年（1361）于朱元璋所部成为相对独立政权时设立，本是独立在六部之外的产物，是明朝武人当时唯一与文官部门一样直接受命于皇帝的机构，洪武十三年(1380)以大都督府权力太大﹐在废丞相制的同时，为防止军权的过分集中，也废大都督府，改为中、左、右、前、后五军都督府，分别管理京师及各地卫所。五军都督府各设左、右都督，正一品；都督同知，从一品；都督佥事，正二品。以中军都督府断事官为五军断事官。
五军都督府分领在京除亲军指挥使司外的各卫所和在外各都司卫所。凡武职世官﹑流官﹑土官之袭替﹑优养﹑优给等项﹐所属皆上报于府﹐府再转送兵部请选。选定后﹐经府下达都司卫所。首领官之选授和给由﹐皆由吏部。其它如武官诰敕﹑水陆步骑之操练﹐军伍之清勾替补﹐俸粮﹑屯费与屯种之器械﹑舟车﹐军情声息﹐边腹地图文册﹑薪炭荆苇诸事﹐移与相关机构会同处理﹐各府只有统兵权﹐调兵之权在兵部﹐每逢战事发生﹐由皇帝命将为帅﹐调领五军都督府所辖卫所之兵佩印出征。军还即归印于朝﹐兵回卫所。明中后期五军都督府失去了参政﹑议政权，由“总内外诸军事”的中枢机构变成处处受制于兵部的单纯执行命令的机构，则是一分为五背后都督府实权削弱殆尽的事实。五军都督府调有统兵权而无调兵权，兵部拥有调兵权而无统兵权。五军都督府和兵部相互节制互不统属，都听命于皇帝。
但是，现在，南京皇宫宫城外洪武门西侧的五军都督府，一改往日颓废气象，又是一番振衰起敝的新景象。
正对着礼户吏兵工五部衙门的五军都督府辕门前高高矗立起两座三丈高的旗杆，旗杆上两面一丈见方的白色绸缎制成、红色火焰镶边，上面用血红大字写成六字，南面这座旗杆上写的是：“补天裂”，北面这座旗杆上写的是：“完金瓯”。旗杆下面，数百名近卫官兵各执刀枪火铳分班肃立，那钢浇铁铸般的军容军姿令在南京城中生活多年的百姓啧啧称奇引为一景前来观看。
在这些站班的近卫官兵两侧，则是李守汉的各个官衔旗牌。最为明显威风的，便是弘光皇帝亲自授予的，总督讨逆诸军各路兵马钱粮事。
这些都无声的向所有的人释放出强烈的信号，这座建筑物，如今是大明这半壁江山当中的权力核心。
不远处的宫城内传来了阵阵低沉而有力的号子声，不时的有输送建筑施工材料的大小车辆辘辘碾压着宫城周围的青石路面走过。这些车辆材料是为了维修荒废已久的南京皇宫所
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